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就在宫内外乱成一锅粥的时候，太医院使向明光帝上书进言，大意就是，经过我们太医院集体不眠不休的研究，觉得《防疫手册》上的内容或可试试，有用的话，京城之危立解，就是没用，以现在的紧急状况，事情也不会坏到哪里去了，而且经过我们太医院的讨论，《防疫手册》上的内容应该是有用的。
明光帝一开始是惊过头乱了方寸，想到那《防疫手册》写的东西，当即下令太医院可照书上记载办理行事，宫廷内外都要全力配合，不可故意拖延或人为制造障碍。
同时，宫内遣御林军，宫外派京兆尹领城防卫协助行事。
京兆尹当即召集城中各大医馆的坐馆大夫和学徒，宫内下来的太医并不啰嗦，把翰林院加班连夜抄录的《防疫手册》分发下去，逐章逐字解释清楚，这个时候，什么捉老鼠打蟑螂已经是来不及了，重点学习环境消杀和戴口罩手套自身防护那几章。
众人拾柴火焰高，经过两天一夜的会谈学习，按照书上的步骤，把人分成这几个组：消毒组、会诊组，护理组和后勤组。
消毒组由城防卫和琼天府衙役组成，每组七个人，一共十组，轮班日夜不停在城内城外水井、河流、沟渠等处巡视，不许百姓随意在沟渠中洗衣和倾倒排泄物，饮水集中管理，每隔两个时辰泼洒石灰水进行消杀。
城内百姓无故不得出城，除每日必须用品采购外，不许在街头长时间逗留，类似酒楼、茶坊、赌场、秦楼楚馆等人员流动密集处，按京城重大事务临时条例，对聚集人员进行登记后驱散，对驱散后的场所进行集中消毒处理。
这点实行起来倒没啥阻力，主要没人不害怕瘟疫，命只有一条，死了就不能吃喝玩乐了，有钱在这些场所厮混的，一时逍遥和长久逍遥哪个重要还是拎得清的。
城内则是每隔四个时辰，对京城大街小巷及东西市场等泼洒石灰水消毒。
这是消杀组的活计。
对于已经发现伤寒病人的村庄，第一要紧是围起来，防止百姓走脱后将病毒带去附近村落，导致疫病大面积爆发，这是一切的基础。
京畿地区发现疫病病人的村庄共有两处，一处五十户，一处百户，都是规模不小的村庄了。
当蒙眼遮面身穿厚厚防护服的卫士把村庄层层包围起来后，村里不管得病的还是不得病的，心都凉了半截。
这个年代对发现疫情的村庄怎么处置？
一般就是象征性给点医药食物，
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